Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
BicraF8VPZ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
BicraF8VPZ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms