Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm28038F7BCN9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28038F7BCN9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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