Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5624F6ZZG8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5624F6ZZG8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5624F6ZZG8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms