Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod3E9QA62 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms