Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms