Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms