Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcom1E9PZ54 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms