Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3lE9PWZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms