Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG8

9530053A07Rik, RIKEN cDNA 9530053A07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 2,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530053A07RikE9PVG8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms