Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm6133B2RY53 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6133B2RY53 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6133B2RY53 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms