Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R2

Spin2d, Spindlin family, member 2D, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2dB1B0R2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spin2dB1B0R2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spin2dB1B0R2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spin2dB1B0R2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms