Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem238A9JSM3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms