Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b5A3FIN4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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