Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms