Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Frmpd1A2AKB4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Frmpd1A2AKB4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms