Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms