Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calcoco2A2A6M5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms