Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc112A0AUP1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms