Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms