Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVP8

Gm5580, Predicted pseudogene 5580, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5580A0A0N4SVP8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5580A0A0N4SVP8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5580A0A0N4SVP8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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