Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH3

AU041133, Expressed sequence AU041133, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU041133A0A0J9YVH3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU041133A0A0J9YVH3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms