Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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