Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Kdm4a-203ENSMUST00000106403 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm45757-201ENSMUST00000211835 1480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ebf1-201ENSMUST00000081265 5981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm2071-201ENSMUST00000193335 774 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC153363.1-201ENSMUST00000213572 359 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Dhrs7b-201ENSMUST00000042281 1553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ica1l-205ENSMUST00000189776 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Arhgap26-216ENSMUST00000155576 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm16059-201ENSMUST00000135583 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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