Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 BC051665-201ENSMUST00000026078 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm13413-201ENSMUST00000120953 602 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms