Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Usp12Q9D9M2 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp12Q9D9M2 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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