Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tulp1Q9Z273 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp1Q9Z273 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms