Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uso1Q9Z1Z0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms