Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms