Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hsf4Q9R0L1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms