Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek3Q9R0A5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms