Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chaf1aQ9QWF0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chaf1aQ9QWF0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms