Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b2Q9JME5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b2Q9JME5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b2Q9JME5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms