Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms