Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml1Q9JIZ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms