Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF7

Hpgds, Hematopoietic prostaglandin D synthase, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdsQ9JHF7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HpgdsQ9JHF7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HpgdsQ9JHF7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms