Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Ndst4Q9EQW8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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Ndst4Q9EQW8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Ndst4Q9EQW8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Ndst4Q9EQW8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst4Q9EQW8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Ndst4Q9EQW8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Ndst4Q9EQW8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst4Q9EQW8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst4Q9EQW8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst4Q9EQW8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst4Q9EQW8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst4Q9EQW8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Ndst4Q9EQW8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndst4Q9EQW8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Ndst4Q9EQW8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst4Q9EQW8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms