Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1ra8Q9EQ48 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms