Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms