Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rp2Q9EPK2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rp2Q9EPK2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms