Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnft1Q9DCN7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnft1Q9DCN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms