Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms