Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pop5Q9DB28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms