Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930449I24RikQ9D5E3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms