Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms