Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5430402E10RikQ9D3N5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms