Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acer3Q9D099 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acer3Q9D099 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms