Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrtapQ9CYD3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CrtapQ9CYD3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CrtapQ9CYD3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CrtapQ9CYD3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CrtapQ9CYD3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms