Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms