Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rpl17Q9CPR4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl17Q9CPR4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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