Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAGR1Q9BTK6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms